Menjelang 1 menit terakhir,Takaaki Nakagami (LCR Honda) mencuri perhatian, ia mampu membuntuti Marc Marquez di posisi kedua.
Di detik terakhir, duo Monster Energy Yamaha Fabio Quartararo dan Maverick Vinales mampu memberi kejutan dengan mencatat waktu tercepat pertama dan kedua.
Sementara Marc harus terlempar ke peringkat keenam klasemen Q2, sedangkan Valentino Rossi mampu naik ke peringkat sembilan dengan catatan waktu 1 menit 33,391 detik.
Berikut hasil kualifikasi MotoGP Prancis 2021, Sabtu (15/5/2021).
| POS. | PEMBALAP | NEGARA | TIM |
| 1 | Fabio Quartararo | FRA | Monster Yamaha (YZR-M1) |
| 2 | Maverick Vinales | SPA | Monster Yamaha (YZR-M1) |
| 3 | Jack Miller | AUS | Ducati Team (GP21) |
| 4 | Franco Morbidelli | ITA | Petronas Yamaha (YZR-M1) |
| 5 | Johann Zarco | FRA | Pramac Ducati (GP21) |
| 6 | Marc Marquez | SPA | Repsol Honda (RC213V) |
| 7 | Takaaki Nakagami | JPN | LCR Honda (RC213V) |
| 8 | Pol Espargaro | SPA | Repsol Honda (RC213V) |
| 9 | Valentino Rossi | ITA | Petronas Yamaha (YZR-M1) |
| 10 | Miguel Oliveira | POR | Red Bull KTM (RC16) |
| 11 | Lorenzo Savadori | ITA | Aprilia Gresini (RS-GP) |
| 12 | Luca Marini | ITA | Sky VR46 Avintia Ducati (GP19) |
| 13 | Aleix Espargaro | SPA | Aprilia Gresini (RS-GP) |
| 14 | Joan Mir | SPA | Suzuki Ecstar (GSX-RR) |
| 15 | Alex Rins | SPA | Suzuki Ecstar (GSX-RR) |
| 16 | Francesco Bagnaia | ITA | Ducati Team (GP21) |
| 17 | Danilo Petrucci | ITA | KTM Tech3 (RC16) |
| 18 | Iker Lecuona | SPA | KTM Tech3 (RC16) |
| 19 | Alex Marquez | SPA | LCR Honda (RC213V) |
| 20 | Tito Rabat | SPA | Pramac Ducati (GP21) |
| 21 | Brad Binder | RSA | Red Bull KTM (RC16) |
| 22 | Enea Bastianini | ITA | Avintia Ducati (GP19)* |