Francesco Bagnaia untuk pertama kalinya berada di posisi tiga besar usai sempat mencatatkan waktu terbaik kedua dengan torehan 2 menit 11.528 detik.
Sementara itu, Fabio Quartararo langsung bereaksi dengan menggeser Francesco Bagnaia ke posisi ketiga dengan usai menorehkan waktu 2 menit 11.231 detik.
10 menit tersisa, posisi teratas yang ditempat Johann Zarco sempat berhasil digeser oleh pembalap pengganti Andrea Dovizioso di RNF, Cal Crutchlow dengan catatan waktu 2 menit 10.485 detik.
Tak berlangsung lama, Miguel Oliveira (KTM) menunjukan kebolehannya di atas lintasan basah usai sempat menjadi yang tercepat dengan catatan waktu 2 menit 10.475 detik.
Lima menit tersisa, Marc Marquez sempat menjadi yang tercepat usai mencatatkan waktu 2 menit 10.411 detik.
Sayangnya torehan itu mampu cepat digeser hingga posisinya langsung turun ke posisi lima.
Franco Morbidelli, kembali menorehkan catatan waktu terbaik usai menorehkan 2 menit 09.390 detik.
Dua menit tersisa, Alex Marquez (LCR) mampu mengalahkan catatan milik Franco Morbidelli usai menorehkan waktu 2 menit 08.436 detik.
Namun catatan waktu itu tak bertahan lama usai Cal Crutchlow mencatatatkan waktu tercepat 2 menit 05.710 detik.
Torehan itu diikuti oleh Francesco Bagnaia dan Alex Marquez yang berada di posisi kedua dan ketiga.
| Hasil tes FP2 MotoGP Malaysia 2022 | ||
| POS | Pembalap | Tim |
| 1 | Cal Crutchlow | WithU RNF Yamaha (YZR-M1) |
| 2 | Francesco Bagnaia | Ducati Lenovo (GP22) |
| 3 | Alex Marquez | LCR Honda (RC213V) |
| 4 | Jack Miller | Ducati Lenovo (GP22) |
| 5 | Johann Zarco | Pramac Ducati (GP22) |
| 6 | Maverick Viñales | Aprilia Factory (RS-GP) |
| 7 | Franco Morbidelli | Monster Yamaha (YZR-M1) |
| 8 | Joan Mir | Suzuki Ecstar (GSX-RR) |
| 9 | Fabio Quartararo | Monster Yamaha (YZR-M1) |
| 10 | Luca Marini | Mooney VR46 Ducati (GP22) |
| 11 | Miguel Oliveira | Red Bull KTM (RC16) |
| 12 | Alex Rins | Suzuki Ecstar (GSX-RR) |
| 13 | Marco Bezzecchi | Mooney VR46 Ducati (GP21)* |
| 14 | Raul Fernandez | KTM Tech3 (RC16)* |
| 15 | Marc Marquez | Repsol Honda (RC213V) |
| 16 | Brad Binder | Red Bull KTM (RC16) |
| 17 | Jorge Martin | Pramac Ducati (GP22) |
| 18 | Remy Gardner | KTM Tech3 (RC16)* |
| 19 | Fabio Di Giannantonio | Gresini Ducati (GP21)* |
| 20 | Tetsuta Nagashima | LCR Honda (RC213V) |
| 21 | Aleix Espargaro | Aprilia Factory (RS-GP) |
| 22 | Enea Bastianini | Gresini Ducati (GP21) |
| 23 | Pol Espargaro | Repsol Honda (RC213V) |
| 24 | Darryn Binder | WithU RNF Yamaha (YZR-M1)* |